追記でござる

私は採用しませんでしたが、他の解決策についても簡単に書いておきます。

• Firefoxに乗り換える

Chromeのみで起きる問題のようですので、Firefoxを使うのが一番手っ取り早い方法です。最新のverではUIも変わったようですし、Chromeに特に愛着やこだわりのない方はこれを機にブラウザを変えるのも一手でしょう。

• SimpleExtManagerを使って、AutopagerizeとAutoPatchWorkを切り替える

こちらのエクステンションを使う方法です。AutopagerizeとAutoPatchWorkの入ったグループを作成し、そこから有効と無効を切り替えてはどうかと思ったのですがページをリロードする必要があり、自動的なページ遷移を売りとするAutopagerizeの解決策としては不適当であると判断しました。これはこれで便利なエクステンションですので、グループ化してエクステンションを扱いたい方にはお勧めしたい方法です。